吉林大學研究生院建于1984年6月，是經國務院批準的全國22所重點大學首批試辦的研究生院之一。1996年3月，經原國家教委批準又成為首批正式建院的研究生院之一。吉林大學研究生教育起步較早，1949年開始招收研究生班，1952年開始招收三年制研究生，1978年開始培養學位研究生。1985年10月，經國務院批準，吉林大學成為首批建立博士后科研流動站的單位之一。
吉林大學現有碩士學位授權點311個，專業學位碩士授權學科7個；博士學位授權點240個，一級學科學位授權學科44個，專業學位博士授權學科2個，博士后科研流動站37個；有博士生指導教師1186人，在校研究生25507人。
多年來，吉林大學一直把人才培養質量視為學位與研究生教育的生命線。為此，研究生院采取了一系列重要措施：嚴格審查報考資格；科學制定研究生培養方案；不斷更新課程設置；嚴格學位授予標準；建立健全各項規章制度，嚴格管理；重視研究生德育教育，加強研究生的思想政治工作等。同時，研究生院還進行了學位與研究生教育方面的改革：優秀碩士生直接攻讀博士學位；本—碩連讀和碩—博連讀等多種培養模式；為企業或行業培養應用型、復合型碩士研究生；招收法律碩士、工程碩士、工商管理碩士（MBA）、公共管理碩士（MPA）專業學位研究生；臨床醫學、口腔醫學碩士及博士專業學位研究生；開展在職人員申請博士、碩士學位等。 吉林大學的學位與研究生教育工作將在改革中求發展，競爭中求領先。2005年吉林大學研究生招生規模為6620人，其中博士生1500人，碩士生5120人。現在，吉林大學研究生院已經成為學科門類比較齊全、培養質量較高的我國重要的研究生培養基地。
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